《哥斯拉2：怪兽之王》主要讲的是在哥斯拉与基多拉的王者之争，三头王者基多拉是哥斯拉的强劲对手，最终谁胜利谁就将统领怪兽世界的故事。
哥斯拉自第一部中击败穆托夫妇后一直沉寂在深海，而这个时候的世界已经大乱，来自外星的怪兽三头巨龙基多拉以绝对的实力统治怪兽世界，这时候不得不将哥斯拉唤醒来对付恶龙基多拉，首战南极哥斯拉不敌恶龙，二次海战哥斯拉咬下基多拉一只头颅，但基多拉瞬间恢复头颅。在最后一次恶战中，哥斯拉被魔斯拉激化进入红莲状态，哥斯拉不断变大，其体积和力量都超过基多拉，最后杀死基多拉，哥斯拉称霸怪兽世界。
